Prírodovedný päťboj je medzitriedna súťaž tretiackych kolektívov GPH v riešení úloh prírodovedného charakteru. Súťažia 5-členné družstvá delegované jednotlivými triedami a riešia spolu 10 úloh - po dve úlohy z predmetov matematika, fyzika, chémia, biológia a informatika. Súťaž sa koná spravidla v prvej polovici novembra a na jej organizovaní sa podieľajú predmetové komisie všetkých prírodovedných predmetov. Autorkou myšlienky Prírodovedného päťboja je RNDr. Mária Dományová. Ceny do súťaže sú zabezpečované z Fondového účtu na podporu prírodovedných talentov, ktorý založil v r. 2004 pán Mário Drosc - olympionik v prírodovedných predmetoch, absolvent GPH, dnes významný bankový manažér.